⑴選用耐蝕材料;

在換熱器等關鍵部位或因工藝要求金屬器壁較薄的地方，可選用耐微生物腐蝕的金屬。幾種常用金屬耐微生物腐蝕的性能排列如下：

鈦＞不銹鋼＞黃銅＞純銅＞硬鋁＞碳鋼

這是在一般情況下的大致排列，在一些特殊環境中則應具體分析，選用材料。例如在合成氨廠，大氣中氨含量較高，則銅的腐蝕速度很快。

⑵控制水質;

做好水質清潔工作的目的是去除水的油、懸浮物等微生物的營養物。對于在含塵量較大的環境中的冷卻水系統，最好加裝旁濾設備。

⑶采用殺生涂料;

用添加有能抑制微生物生長的殺生劑（如偏硼酸鋇、氧化亞銅、氧化鋅、三丁基氧化錫等）的特種涂料涂刷換熱器的冷卻水一側，既能保護金屬不受腐蝕，又能防止微生物粘泥的沉積，并且對水垢的沉積也有一定的預防作用。這種涂料的熱阻較小，對換熱效果影響不大。

用由酸性水玻璃、氧化亞銅、氧化鋅和填料等組成的無機防藻涂料涂刷在冷卻塔和水池內壁上，可有效地控制藻類的生長。

⑷陰極保護;

采用外加電流保護法或犧牲陽極保護法，可控制陰極金屬上硫酸鹽還原菌的繁殖

⑸清洗;

用物理或化學清洗的方法去除微生物粘泥，可去除大部分的微生物，并破壞了微生物賴以生存的環境，微生物繁殖的速度受挫。

清洗后剩下來的微生物暴露在外，更易于被殺生劑殺死。

對于一個已經被微生物嚴重污染的冷卻水系統來說，清洗是一個十分有效的措施

⑹防止陽光照射;

采用各種方式防止或減少陽光直接照射冷卻水，可大幅降低藻類繁殖的速度。

⑺旁流過濾;

⑻混凝沉淀;

⑼噬菌體法;

噬菌體法也叫細菌病毒，是一種能吃掉細菌的微生物，是一種生物殺菌方法。

噬菌體靠寄生在叫做“宿主”的細菌里繁殖，繁殖的結果是將“宿主”吃掉，這種過程叫溶菌作用。噬菌體繁殖的后代又寄生到其它的細菌里，其數量成百上千地增長，因此用噬菌體法殺菌只須加少量噬菌體即可，靠它的自我繁殖可達到殺菌的目的，因此費用較低。

據報道，噬菌體法殺菌對控制濱海火力發電站冷卻水系統及造紙廠冷卻水系統微生物繁殖十分有效。但在其它系統中應用效果未見類似的報告。

⑽添加殺生劑;

往冷卻水系統中添加殺生劑（也稱殺菌滅藻劑）是控制微生物繁殖的最有效、最常用的方法之一。只要選藥得當，方法合適，添加殺生劑能有效控制微生物的繁殖。

通常情況下，幾種方法聯合使用效果較好，費用較低。

⑾靜電水處理與電子水處理;